Programme

Semaine Mer. 24 Jeu. 25 Ven. 26 Liste

	Mer. 24	Jeu. 25	Ven. 26
08:00 09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00 18:00 19:00 20:00 21:00	Accueil tutoriels 13:00 - 13:30 (30min) Accueil tutoriels Accueil des tutoriels Tutoriels 13:30 - 16:30 (3h) Tutoriels Introduction à RCpp (Romain François) Introduction à la programmation orientée objet (Christophe Genolini) Table ronde 17:00 - 19:30 (2h30) Table ronde Utilisation du R dans le monde industriel Pot d'accueil 19:30 - 21:00 (1h30) Pot d'accueil Pot d'accueil	Accueil 8:00 - 9:00 (1h) Accueil Accueil des participants avec café de bienvenu R, Data Science... et Formation 9:00 - 9:45 (45min) R, Data Science... et Formation Erwann Le Pennec Visualisation 9:45 - 10:45 (1h) Visualisation › Graphiques interactifs en analyse de données avec Factoshiny - François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes 09:45-10:05 (20min) › visNetwork : création et visualisation intéractives de réseaux - Benoit Thieurmel, DataKnowledge 10:05-10:25 (20min) › Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero - Madalina Olteanu, SAMM (Statistique, Analyse et Modélisation Multidisciplinaire), EA4543 10:25-10:45 (20min) Pause café 10:45 - 11:15 (30min) Pause café Application Modélisation 11:15 - 12:15 (1h) Application › Un package R pour modéliser la survie en tenant compte des effets centres et des risques compétitifs - Marie DE ANTONIO, Centre de Recherche des Cordeliers 11:15-11:35 (20min) › Une étude de cas en biomécanique avec la fonction lme de R pour modéliser des structures complexes d'effets aléatoires et de matrice de variance-covariance des erreurs - Frédérique Letué, Laboratoire Jean Kuntzmann 11:35-11:55 (20min) › A General Method to map Single-cell Probabilistic Trait Loci of the Genome - Florent Chuffart, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule 11:55-12:15 (20min) 11:15 - 12:15 (1h) Modélisation › An extension to generalized pairwise comparisons for prioritized outcomes with censoring - Julien Péron, Hospices Civils de Lyon / Centre hospitalier Lyon Sud, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 11:15-11:35 (20min) › abc : un paquetage R pour le calcul bayésien approché - Michael Gb Blum, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble 11:35-11:55 (20min) › ibr: un paquet R pour la réduction itérative de biais - Eric Matzner-Lober, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes - Pierre-André Cornillon, Département MASS 11:55-12:15 (20min) Déjeuner 12:15 - 14:00 (1h45) Déjeuner Statistique spatiale 14:00 - 14:45 (45min) Statistique spatiale Thibaut Laurent Lightning talk 14:45 - 15:45 (1h) Lightning talk › Compétitions d'apprentissage automatique avec le package rchallenge - robin genuer, Institut de Santé Publique, d'Epidémiologie et de Développement, SISTM 14:45-15:45 (1h) › Datacamp : Apprendre R, en faisant du R, dans R...et en français. - Vincent Guyader, ThinkR 14:45-15:45 (1h) › FreeSortR : un package pour l'analyse de données de tri libre. - Philippe Courcoux, Unité de Sensométrie et Chimiométrie 14:45-15:45 (1h) › L'histoire en miettes : analyse de graphes avec R pour l'étude de la fragmentation des objets archéologiques - Sébastien Plutniak, Centre d'étude des rationalités et des savoirs – équipe du LISST 14:45-15:45 (1h) › Modèles de mutations : étude probabiliste et estimation paramétrique - Adrien MAZOYER, Laboratoire Jean Kuntzmann 14:45-15:45 (1h) › SARTools : un pipeline complet pour l'analyse différentielle de données RNA-Seq - Hugo Varet, Plate-forme Transcriptome et Epigénome, Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative 14:45-15:45 (1h) › Validation de données en phénotypage végétal - Antoine Schorgen, INRA 14:45-15:45 (1h) Pause café 15:45 - 16:15 (30min) Pause café Classification 16:15 - 17:15 (1h) Classification › Clustering divisif monothétique. La package divclust - Marie Chavent, CQFD 16:15-16:35 (20min) › Classification de variables avec possibilité de mettre à l'écart des variables atypiques ou de bruit. Implémentation dans le package ClustVarLV. - Evelyne Vigneau, Oniris, Unité de Sensométrie et Chimiométrie 16:35-16:55 (20min) › Etude de la robustesse de RMixmod (package de classification par modèles de mélanges) en cas de chevauchement de classes - Florent Langrognet, Laboratoire de Mathématiques 16:55-17:15 (20min) jsonlite et mongolite 17:15 - 18:00 (45min) jsonlite et mongolite Jeroen Ooms Poster 18:00 - 18:20 (20min) Poster › An experimental assessment of the "Gibbs-Energy and Empirical-Variance" estimating equations (via Kalman smoothing) for Matérn processes - Didier Girard, Laboratoire Jean Kuntzman 18:00-18:20 (20min) › Bayesian Analysis of Connectivity in Macaque Cerebral Cortex using JAGS and Stan - Artemis Toumazi, Inserm U846, Stem Cell and Brain Research Institute 18:00-18:20 (20min) › Computational optimisation for mixOmics, the R package dedicated to 'omics' data integration - FRANÇOIS BARTOLO, Institut de Mathématiques de Toulouse 18:00-18:20 (20min) › Identifier des biomarqueurs en métagénomique quantitative : la promesse du Big Data - Magali Berland, INRA 18:00-18:20 (20min) › Maximum likelihood conjoint measurement: From GLM to GAM - Kenneth Knoblauch, Stem Cell and Brain Research Institute 18:00-18:20 (20min) › Packages R pour la détection d'observations atypiques multivariées. - Aurore Archimbaud, Groupe de recherche en économie mathématique et quantitative 18:00-18:20 (20min)	Accueil 8:30 - 9:00 (30min) Accueil Accueil des participants pour le vendredi De la concision à l’efficacité, le cauchemar d’un informaticien 9:00 - 9:45 (45min) De la concision à l’efficacité, le cauchemar d’un informaticien Floreal Morandat Big data 9:45 - 10:45 (1h) Big data › BIG-SIR a Sliced Inverse Regression Approach for Massive Data - Benoit Liquet, School of Mathematics and Physics 09:45-10:05 (20min) › PARConnector : sans détour du Langage R au Cloud Big Data - Application à l'analyse Metagenomique - 10:05-10:25 (20min) › Rtkpp: Un package pour faire l'interface entre R et la bibliothèque STK++ - Serge Iovleff, UMR 8524 10:25-10:45 (20min) Pause café 10:45 - 11:15 (30min) Pause café Divers Classification 11:15 - 12:15 (1h) Divers › Reporting automatisé avec ReporteRs et rtable - David Gohel, Société Lysis 11:15-11:35 (20min) › The Rsocialdata.network extension: Handling and analysing egocentric network survey data in R - Emmanuel Rousseaux, Institute of Information and Service Science, Institute for Demographic and Life Course Studies, PRN LIVES 11:35-11:55 (20min) › «MTK» : un package pour unifier les démarches d'exploration numérique de modèles - Juhui WANG, Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement 11:55-12:15 (20min) 11:15 - 12:15 (1h) Classification › ClustInvest : outils pour l'analyse et l'interprétation de classifications nonsupervisées avec variables binaires. Application à des données d'accidents de décompression - Gérard Grégoire, Laboratoire Jean Kuntzmann - Jean-Pierre Imbert, Société Divetech 11:15-11:35 (20min) › Paquet R pour l'estimation d'un mélange de lois de Student multivariées à échelles multiples. - Alexis Arnaud, MISTIS 11:35-11:55 (20min) › Le package ClustGeo : Classification ascendante hiérarchique avec contraintes de proximité géographique - Amaury Labenne, IRSTEA. UR ETBX 11:55-12:15 (20min) Déjeuner 12:15 - 13:30 (1h15) Déjeuner Représentation et traitement de l'information géographique avec R 13:30 - 14:15 (45min) Représentation et traitement de l'information géographique avec R Timothee Giraud Classification fonctionnelle 14:15 - 14:55 (40min) Classification fonctionnelle › funFEM: an R package for functional data clustering - Charles Bouveyron, Mathématiques appliquées Paris 5 - Julien Jacques, Entrepôts, Représentation et Ingénierie des Connaissances 14:15-14:35 (20min) › kmlShape : un algorithme de partitionnement des données longitudinales basé sur la forme des trajectoires - Christophe Genolini, UMR 1027, INSERM, Université Paul Sabatier, Toulouse III, France, CeRSM (EA 2931), UFR STAPS, Université de Paris Ouest-Nanterre-La Défense, France 14:35-14:55 (20min) Big data 14:55 - 15:35 (40min) Big data › MRIaggr : un package pour la gestion et le traitement de données multivariées d'imagerie - Brice OZENNE, Hospices Civils de Lyon / Centre hospitalier Lyon Sud, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive 14:55-15:15 (20min) › LEA : un package R pour la génomique des populations - Olivier Francois, TIMC-IMAG laboratory 15:15-15:35 (20min) Clôture 15:35 - 15:45 (10min) Clôture Clôture des 4èmes Rencontres R

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