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08:00 - 09:00
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Accueil - Accueil des participants avec café de bienvenu |
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09:00 - 09:45
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R, Data Science... et Formation - Erwann Le Pennec |
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09:45 - 10:45
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Visualisation |
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| 09:45 - 10:05 |
› Graphiques interactifs en analyse de données avec Factoshiny - François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes |
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| 10:05 - 10:25 |
› visNetwork : création et visualisation intéractives de réseaux - Benoit Thieurmel, DataKnowledge |
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| 10:25 - 10:45 |
› Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero - Madalina Olteanu, SAMM (Statistique, Analyse et Modélisation Multidisciplinaire), EA4543 |
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10:45 - 11:15
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Pause café |
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11:15 - 12:15
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Application |
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| 11:15 - 11:35 |
› Un package R pour modéliser la survie en tenant compte des effets centres et des risques compétitifs - Marie DE ANTONIO, Centre de Recherche des Cordeliers |
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| 11:35 - 11:55 |
› Une étude de cas en biomécanique avec la fonction lme de R pour modéliser des structures complexes d'effets aléatoires et de matrice de variance-covariance des erreurs - Frédérique Letué, Laboratoire Jean Kuntzmann |
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| 11:55 - 12:15 |
› A General Method to map Single-cell Probabilistic Trait Loci of the Genome - Florent Chuffart, Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule |
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11:15 - 12:15
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Modélisation |
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| 11:15 - 11:35 |
› An extension to generalized pairwise comparisons for prioritized outcomes with censoring - Julien Péron, Hospices Civils de Lyon / Centre hospitalier Lyon Sud, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive |
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| 11:35 - 11:55 |
› abc : un paquetage R pour le calcul bayésien approché - Michael Gb Blum, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble |
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| 11:55 - 12:15 |
› ibr: un paquet R pour la réduction itérative de biais - Eric Matzner-Lober, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes - Pierre-André Cornillon, Département MASS |
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12:15 - 14:00
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Déjeuner |
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14:00 - 14:45
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Statistique spatiale - Thibaut Laurent |
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14:45 - 15:45
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Lightning talk |
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| 14:45 - 15:45 |
› Compétitions d'apprentissage automatique avec le package rchallenge - robin genuer, Institut de Santé Publique, d'Epidémiologie et de Développement, SISTM |
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| 14:45 - 15:45 |
› Datacamp : Apprendre R, en faisant du R, dans R...et en français. - Vincent Guyader, ThinkR |
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| 14:45 - 15:45 |
› FreeSortR : un package pour l'analyse de données de tri libre. - Philippe Courcoux, Unité de Sensométrie et Chimiométrie |
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| 14:45 - 15:45 |
› L'histoire en miettes : analyse de graphes avec R pour l'étude de la fragmentation des objets archéologiques - Sébastien Plutniak, Centre d'étude des rationalités et des savoirs – équipe du LISST |
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| 14:45 - 15:45 |
› Modèles de mutations : étude probabiliste et estimation paramétrique - Adrien MAZOYER, Laboratoire Jean Kuntzmann |
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| 14:45 - 15:45 |
› SARTools : un pipeline complet pour l'analyse différentielle de données RNA-Seq - Hugo Varet, Plate-forme Transcriptome et Epigénome, Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative |
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| 14:45 - 15:45 |
› Validation de données en phénotypage végétal - Antoine Schorgen, INRA |
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15:45 - 16:15
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Pause café |
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16:15 - 17:15
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Classification |
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| 16:15 - 16:35 |
› Clustering divisif monothétique. La package divclust - Marie Chavent, CQFD |
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| 16:35 - 16:55 |
› Classification de variables avec possibilité de mettre à l'écart des variables atypiques ou de bruit. Implémentation dans le package ClustVarLV. - Evelyne Vigneau, Oniris, Unité de Sensométrie et Chimiométrie |
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| 16:55 - 17:15 |
› Etude de la robustesse de RMixmod (package de classification par modèles de mélanges) en cas de chevauchement de classes - Florent Langrognet, Laboratoire de Mathématiques |
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17:15 - 18:00
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jsonlite et mongolite - Jeroen Ooms |
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18:00 - 18:20
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Poster |
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| 18:00 - 18:20 |
› An experimental assessment of the "Gibbs-Energy and Empirical-Variance" estimating equations (via Kalman smoothing) for Matérn processes - Didier Girard, Laboratoire Jean Kuntzman |
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| 18:00 - 18:20 |
› Bayesian Analysis of Connectivity in Macaque Cerebral Cortex using JAGS and Stan - Artemis Toumazi, Inserm U846, Stem Cell and Brain Research Institute |
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| 18:00 - 18:20 |
› Computational optimisation for mixOmics, the R package dedicated to 'omics' data integration - FRANÇOIS BARTOLO, Institut de Mathématiques de Toulouse |
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| 18:00 - 18:20 |
› Identifier des biomarqueurs en métagénomique quantitative : la promesse du Big Data - Magali Berland, INRA |
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| 18:00 - 18:20 |
› Maximum likelihood conjoint measurement: From GLM to GAM - Kenneth Knoblauch, Stem Cell and Brain Research Institute |
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| 18:00 - 18:20 |
› Packages R pour la détection d'observations atypiques multivariées. - Aurore Archimbaud, Groupe de recherche en économie mathématique et quantitative |
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